Zur Verstärkung in der personalisierten Tumordiagnostik in der Abteilung Molekularpathologie sucht das Institut für Pathologie zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen Bio-Informatiker/Informatiker als wissenschaftlichen Mitarbeiter (w/m/d). Die Stelle ist zunächst befristet zu besetzen. Eine Verlängerung ist prinzipiell möglich und wird angestrebt. Die Vergütung erfolgt nach TV-L und richtet sich nach den persönlichen Voraussetzungen. Das Startdatum ist baldmöglichst oder spätestens Winter 2022.


Ihre Aufgaben:

• Implementierung und Pflege von bio-informatorischen Lösungen für die Tumor-Diagnostik/NGS-Analytik von DNA, RNA, WGS, WES, Methylierung.
• Pipelineentwicklung, Nextflow-/Workflow-Entwicklung, Dockerization
• Einbindung von insbesondere Sequenzierplattformen in Routineprozesse
• Konzeptionelles und operatives Handeln zu Datenspeicherung und -Archivierung
• Mitarbeit bei innovativen und teils national angelegten Diagnostikprojekten und Zusammenarbeit mit internen IT-Partnern
• Schulung von technischem und naturwissenschaftlichem Personal bei der Nutzung der etablierten digitalen Prozesse
• Mitarbeit im Qualitätsmanagement

Was wir Ihnen bieten:

• Selbständiges Arbeiten in einem jungen, dynamischen Team.
• Möglichkeit, Forschungsprojekte des Instituts maßgeblich mitzugestalten
• Bezahlung nach TV-L sowie betriebliche Altersvorsorge
• Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
• Vielfältige Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten sowie betriebliche Gesundheitsförderung
• Personalwohnheim sowie Jobticket

Ihr Profil:

• Abgeschlossenes Studium der Bio-Informatik, Informatik oder verwandte Fächer mit Bio-IT Schwerpunkt.
• Kenntnisse in der Next-Generation-Sequenzierung (speziell Illumina) insbesondere NGS-Pipelines und von gängigen Tools und Programmiersprachen der Bioinformatik
• Idealerweise haben Sie bereits Erfahrungen mit command line basierte Scriptsprache (z.B. Linux, Phyton, etc.)
• Erfahrungen in der Zusammenarbeit mit Naturwissenschaftlern in der Medizin sind von Vorteil
• Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift
• Hohe Eigeninitiative und Flexibilität bei wechselnden Anforderungen
• Teamgeist sowie eine selbstständige, lösungsorientierte und präzise Arbeitsweise