Die Klinik für Innere Medizin II vertritt im Zentrum für Innere Medizin die Schwerpunkte Kardiologie, Angiologie, Pneumologie, Internistische Intensivmedizin sowie Sport- und Rehabilitationsmedizin in Krankenversorgung, ärztlicher Weiterbildung, Lehre und Forschung und ist integraler Bestandteil des Universitären Herzzentrums Ulm. In diesem betreibt die Klinik unter anderem eine zertifizierte Chest-Pain-Unit, überregionale Heart-Failure-Unit, EMAH-Unit, Heart-Valve-Unit (TAVI- und Mitralklappenzentrum) sowie ein Herzrhythmuszentrum (Aggregat- und Ablationszentrum).
Die Klinik verfügt über 5 Hybridkatheterlabore und ist zertifizierte Weiterbildungsstätte für interventionelle Kardiologie, Rhythmologie (2 EPU-Labore, 1 Device-Implantationssaal), kardiale Magnetresonanztomographie (2 Magnetresonanztomographen (1.5 und 3 Tesla)), sowie interventionelle Angiologie.
In der stationären Versorgung verfolgt die Klinik ein modernes Konzept mit getrennten Pfaden für Notfallpatienten (w/m/d); diese werden auf einer CPU-Decision-Unit gesichtet, und auf einer CPU-Therapy-Unit stationär weiterbehandelt. Für strukturelle Herzerkrankungen steht eine spezialisierte Herzklappenstation mit Überwachungseinheit, für Herzinsuffizienzpatienten (w/m/d) eine Heart-Failure-Unit mit 5 Behandlungsplätzen zur Verfügung. Die Intensivstation verfügt über 17 Beatmungsplätze und alle Möglichkeiten für Organersatzverfahren einschließlich VA- und VV-ECMO. 

In nationalen und internationalen Forschungsverbünden zielt unsere klinische Forschung vor allem auf die Entwicklung neuer katheterinterventioneller Herzklappentherapien und Herzrhythmustherapien ab, sowie die Weiterentwicklung der interventionellen kardialen Bildgebung mittels Echokardiographie, MRT und CT. In unserem Institut für Molekulare Kardiologie (Institutsleitung: Prof. Dr. Just) fokussieren wir uns auf die systematische Entschlüsselung der molekularen Ursachen von Herz-Kreislauferkrankungen, genetischer Herzerkrankungen und angeborener Herzfehler. Des Weiteren arbeiten wir in nationalen und internationalen Forschungsverbünden an der Entwicklung therapeutischer Ansätze zur Herzregeneration.

Die Klinik verfügt über die volle Weiterbildungsermächtigung für das Fach Innere Medizin und Kardiologie sowie Innere Medizin und Angiologie. Nach abgeschlossener  Facharztausbildung besteht unter anderem die Möglichkeit zur Zusatzweiterbildung in Intensivmedizin, Klinischer Akut- und Notfallmedizin, Spezieller Kardiologie für Erwachsene mit angeborenen Herzfehlern (EMAH) sowie Kardialer Magnetresonanztomographie.