Zur Verstärkung in der personalisierten Tumordiagnostik in der Molekularpathologie sucht das Institut für Pathologie zum nächstmöglichen Zeitpunkt einen Bio-Informatiker / Informatiker als wissenschaftlichen Mitarbeiter (w/m/d). Die Stelle ist zunächst befristet zu besetzen. Eine Verlängerung ist prinzipiell möglich und wird angestrebt. Die Vergütung erfolgt nach TV-L und richtet sich nach den persönlichen Voraussetzungen.

Ihre Aufgaben:

• Implementierung und Pflege von bio-informatorischen Lösungen für die Diagnostik,  NGS-Analytik (DNA, RNA; WES, WGS und Methylierung) und Dokumentation
• Pipelineentwicklung und Workflowentwicklung (Nextflow, Docker)
• Einbindung von Sequenzierergebnissen in das Informationssystem DC-Pathos
• Datenspeicherung und Archivierung 
• Mitarbeit in innovativen und zukunftsweisenden Projekten
• Kooperation mit IT-Partnern und KIS-Systemen
• Schulung des Personals bei der Etablierung von digitalisierten Prozessen
• Strukturierte Aufbereitung von Daten im Behandlungskontext
• Mitarbeit im Qualitätsmanagement

Was wir Ihnen bieten:

• Selbständiges Arbeiten in einem jungen, dynamischen Team
• Möglichkeiten Forschungsprojekte des Instituts mitzugestalten
• Bezahlung nach TV-L sowie betriebliche Altersvorsorge
• Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
• Betriebliche Gesundheitsförderung und Jobticket

Das bringen Sie mit:

• Abgeschlossenes Studium des Bioinformatik, Informatik oder verwandte Fächer mit Bio-IT Schwerpunkt
• Erfahrung im Bereich der Next-Generation-Sequenzierung (Illumina) sowie Pipelines und gängige Tools (Alignment, Variant Calling, etc.)
• Programmierkenntnisse (z.B. nextflow, python, R) und Linuxkenntnisse 
• Kenntnis der englischen Sprache in Wort und Schrift
• Bereitschaft zur Fort- und Weiterbildung
• Kenntnisse im Bereich der Medizininformatik sind von Vorteil